多数先天性处女膜闭锁在青春期前无任何症状。初潮后由于处女膜闭锁导致经血无法排出。最初经血积聚在阴道内，多次月经来潮后，经血逐渐积聚，造成子宫、输卵管积血，甚至腹腔内积血，可引发子宫内膜异位症，也可导致盆腔炎性改变。
先天性处女膜闭锁月经血起初只是在阴道腔里积聚，以后可以向上扩展，最终使子宫腔和两侧输卵管腔都积满月经血。因此病人可出现逐月加剧的周期性腹痛，还可在下腹部清楚地摸到逐渐增大的包块。一旦
输卵管粘膜被经血扩张破坏，就会造成永久性的不育症。
到了青春发育期，随着卵巢功能的成熟，每月有一次月经来潮，但因为处女膜闭锁，经血不能排出，可引起下腹胀痛，而且尿道受积血的压迫，常有排尿困难或不适感。这种下腹胀痛、排尿困难等症状，常呈周期性，较有规律，周而复始。
严重的，经血可通过输卵管伞端倒流入腹腔而造成肠粘连和盆腔粘连。所以，及早发现处女膜闭锁，早期进行治疗是非常重要的。
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